Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZNF330Q9Y3S2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF330Q9Y3S2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms