Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YBX2Q9Y2T7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YBX2Q9Y2T7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YBX2Q9Y2T7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.9 ms