Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SSX2IPQ9Y2D8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SSX2IPQ9Y2D8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms