Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIGD1AQ9Y241 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HIGD1AQ9Y241 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms