Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCN8AQ9UQD0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN8AQ9UQD0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms