Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN9

TRIM33, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM33, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM33Q9UPN9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM33Q9UPN9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM33Q9UPN9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms