Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FZD1Q9UP38 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
FZD1Q9UP38 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FZD1Q9UP38 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms