Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
TTF2Q9UNY4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTF2Q9UNY4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms