Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SNX6Q9UNH7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNX6Q9UNH7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms