Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PADI4Q9UM07 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PADI4Q9UM07 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms