Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH7Q9ULB5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH7Q9ULB5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH7Q9ULB5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms