Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKQ2

ADAM28, Disintegrin and metalloproteinase domain-containing protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADAM28Q9UKQ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ADAM28Q9UKQ2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ADAM28Q9UKQ2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms