Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRDM4Q9UKN5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms