Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PARP4Q9UKK3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PARP4Q9UKK3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms