Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GMEB2Q9UKD1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GMEB2Q9UKD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms