Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TSR3Q9UJK0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSR3Q9UJK0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSR3Q9UJK0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms