Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MCM8Q9UJA3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM8Q9UJA3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM8Q9UJA3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms