Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CDH22Q9UJ99 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDH22Q9UJ99 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms