Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX20Q9UHI6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX20Q9UHI6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX20Q9UHI6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms