Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRPS1Q9UHF7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRPS1Q9UHF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms