Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF20Q9UGU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF20Q9UGU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms