Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NIPSNAP3AQ9UFN0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms