Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CLIP2Q9UDT6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CLIP2Q9UDT6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLIP2Q9UDT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms