Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLKQ9UBT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
POLKQ9UBT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
POLKQ9UBT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms