Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TNFRSF10DQ9UBN6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TNFRSF10DQ9UBN6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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