Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2V4

LRIT1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT1Q9P2V4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRIT1Q9P2V4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LRIT1Q9P2V4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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