Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLHL9Q9P2J3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLHL9Q9P2J3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms