Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MARCH4Q9P2E8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARCH4Q9P2E8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.1 ms