Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL20A1Q9P218 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL20A1Q9P218 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms