Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HACD3Q9P035 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD3Q9P035 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms