Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBP1Q9NZI7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBP1Q9NZI7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBP1Q9NZI7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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