Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZG7

NINJ2, Ninjurin-2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ2Q9NZG7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NINJ2Q9NZG7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NINJ2Q9NZG7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms