Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.271e-6■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 NIPAL3-201ENST00000003912 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 27.7
FAM120AQ9NZB2 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.191e-7■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 SAR1A-207ENST00000452767 672 ntTSL 58.6□□□□□ -1.039e-12■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 AGAP3-219ENST00000485904 683 ntTSL 321.4■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 ASPSCR1-220ENST00000585140 447 ntTSL 320.47■□□□□ 0.875e-24■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 CELF2-202ENST00000399850 7085 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-6■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 CELF2-205ENST00000542579 7982 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 CELF2-209ENST00000631460 5538 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 CELF2-204ENST00000417956 8044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 CELF2-203ENST00000416382 6894 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.082e-6■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.646e-7■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 GNG7-201ENST00000382159 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.286e-7■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 TSPAN4-219ENST00000530404 818 ntTSL 522.84■■□□□ 1.255e-7■■■■■ 27.6
FAM120AQ9NZB2 ORMDL3-205ENST00000581284 561 ntTSL 515.65■□□□□ 0.14e-14■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.712e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 MSH6-203ENST00000420813 491 ntTSL 419.1■□□□□ 0.653e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.183e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 CTNNB1-209ENST00000450969 645 ntTSL 46.03□□□□□ -1.443e-45■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PPP1R3E-205ENST00000560073 444 ntTSL 54.73□□□□□ -1.657e-18■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PRKAR1A-214ENST00000588188 1209 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.973e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PRKAR1A-202ENST00000392710 3551 ntTSL 27.31□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.283e-11■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 317.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 517.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 UNG-203ENST00000446767 2016 ntTSL 1 (best)20.13■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 517.99■□□□□ 0.471e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 27.5
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-207ENST00000527468 571 ntTSL 221.49■■□□□ 1.038e-15■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-209ENST00000424128 633 ntTSL 519.34■□□□□ 0.691e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-216ENST00000440380 537 ntTSL 519.08■□□□□ 0.641e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.618e-15■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-217ENST00000450538 570 ntTSL 415.79■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-211ENST00000427969 520 ntTSL 415.55■□□□□ 0.081e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-215ENST00000439679 626 ntTSL 514.92□□□□□ -0.021e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SUN1-214ENST00000435699 676 ntTSL 313.04□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 521.05■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.572e-8■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 317.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 STAU2-222ENST00000522962 1041 ntTSL 37.33□□□□□ -1.241e-7■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 TSPAN4-215ENST00000525334 860 ntTSL 319.95■□□□□ 0.785e-7■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 SLC16A3-210ENST00000580189 872 ntTSL 520.41■□□□□ 0.863e-8■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.693e-9■■■■■ 27.4
FAM120AQ9NZB2 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 220.47■□□□□ 0.879e-8■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 217.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.385e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 LMNB2-205ENST00000532465 769 ntTSL 320.26■□□□□ 0.832e-10■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.931e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-208ENST00000520872 560 ntTSL 320.57■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.21e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-204ENST00000518767 1146 ntTSL 1 (best)15.88■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-228ENST00000524191 808 ntTSL 313.22□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-203ENST00000518502 687 ntTSL 313.17□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.31e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-202ENST00000517542 1695 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-215ENST00000521727 3953 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-226ENST00000524104 2173 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-216ENST00000521736 550 ntTSL 56.78□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.351e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-205ENST00000518981 1746 ntTSL 26.59□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-227ENST00000524113 658 ntTSL 26.45□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-218ENST00000522061 564 ntTSL 46.26□□□□□ -1.411e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-206ENST00000519818 590 ntTSL 46.1□□□□□ -1.431e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-213ENST00000521447 727 ntTSL 56.05□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-217ENST00000521845 546 ntTSL 55.32□□□□□ -1.561e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-223ENST00000523160 227 ntTSL 34.78□□□□□ -1.641e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.681e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-209ENST00000520945 472 ntTSL 44.27□□□□□ -1.731e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-211ENST00000521293 552 ntTSL 44.13□□□□□ -1.751e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 27.3
FAM120AQ9NZB2 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.117e-7■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 212.27□□□□□ -0.457e-7■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-206ENST00000418000 792 ntTSL 327.77■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.612e-9■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.482e-9■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 315.12■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 VGLL4-213ENST00000445411 726 ntTSL 510.31□□□□□ -0.762e-9■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 PQLC1-204ENST00000466449 2887 ntTSL 218.45■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 TRIP12-208ENST00000430954 719 ntTSL 213.47□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 GATD1-209ENST00000528602 569 ntTSL 215.35■□□□□ 0.056e-8■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 27.2
FAM120AQ9NZB2 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.535e-9■■■■■ 27.2
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 136.7 ms