Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNK4Q9NYG8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms