Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SPHK1Q9NYA1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPHK1Q9NYA1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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