Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY93

DDX56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX56Q9NY93 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX56Q9NY93 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDX56Q9NY93 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms