Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TUBA8Q9NY65 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TUBA8Q9NY65 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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