Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARHGEF38Q9NXL2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARHGEF38Q9NXL2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms