Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM248Q9NWD8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM248Q9NWD8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM248Q9NWD8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms