Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB4Q9NTQ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB4Q9NTQ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB4Q9NTQ9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms