Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC38.9■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
PDS5BQ9NTI5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC38.84■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
PDS5BQ9NTI5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC38.77■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
PDS5BQ9NTI5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms