Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PKDREJQ9NTG1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PKDREJQ9NTG1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms