Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EMILIN3Q9NT22 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMILIN3Q9NT22 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMILIN3Q9NT22 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms