Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC6A13Q9NSD5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SLC6A13Q9NSD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms