Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNIP2Q9NS61 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KCNIP2Q9NS61 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms