Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERINC1Q9NRX5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SERINC1Q9NRX5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms