Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CNNM1Q9NRU3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CNNM1Q9NRU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CNNM1Q9NRU3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms