Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST12Q9NRB3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST12Q9NRB3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms