Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXOSC3Q9NQT5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EXOSC3Q9NQT5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC3Q9NQT5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC3Q9NQT5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC3Q9NQT5 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
EXOSC3Q9NQT5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms