Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PFDN4Q9NQP4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PFDN4Q9NQP4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PFDN4Q9NQP4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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